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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
今日小寒｜光阴流转，年味渐浓！******
葵影便移长至日
梅花先趁小寒开
农历十二月十四
迎来小寒节气
资料图：积雪挂在梅花枝上。泱波 摄它是冬季的第5个节气
也是一个重要的时间节点
表示气温冷暖变化
标志着季冬时节正式开始
十二月节
月初寒尚小，故云
月半则大矣
小寒，冷气积久而寒
天气寒冷但未到极点
资料图：镜心湖岸边树木形成雾凇美景。王金龙 摄小寒大寒，冻成一团
“三九”往往在小寒节气内
此时冷空气活动较为频繁
气温也比较低
古人认为
大雁顺阴阳而迁移
此时阳气已经萌动
大雁开始向北迁移
资料图：候鸟与升金湖周围山川构成一幅美丽画卷。汪欢喜 摄小寒时节有不少可口的美食
将糯米煮熟
配上炒香的“腊味”
以及香菜、葱花等材料
便是入口香甜的糯米饭
三九补一冬
来年无病痛
冬天需注意养护肠胃
少食辛辣油腻的食物
适当吃些五谷杂粮
增强身体的抗寒能力
资料图：图为一匹棕色骏马在雪地里觅食。 苏兴汉 摄外出加强头部保暖
晚上睡前用热水泡脚
室内保持空气流通
预防呼吸道疾病的发生
锻炼身体要循序渐进
白雪飘落，玉树琼枝
酿造的新酒香气扑鼻
与友人围坐在火炉边
品酒赏雪，别有一番滋味
资料图：梅花古寺相得益彰。王东明 摄雪似梅花，梅花似雪
好看的冰窗花与雾凇
是冬日独有的景致
进入小寒
年味也渐渐浓了起来
人们忙着准备年货
写春联、买年画
憧憬着不久之后
那祥和美好的春节
资料图：雾凇美景如画。苍雁 摄小寒连大吕
欢鹊垒新巢
随着时光推移
大自然越来越热闹
春暖花开，春意不远
小寒时节充满希望
人生或许有很多坎坷
但只要意志坚定、踏实努力
终有否极泰来之时
资料图：图为灯笼般的雪中柿子挂满枝头。王三合 摄小寒来临
你对未来有哪些期许？
(记者 上官云)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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